Rechtsträgerin der universitären Bildungseinrichtung UMIT - Private Universität für Gesundheitswissenschaften, Medizinische Informatik und Technik ist die UMIT GmbH, welche sich zu 100 Prozent im Eigentum des Landes Tirol befindet. Organe dieser Gesellschaft sind zwei Geschäftsführer, der Aufsichtsrat und die Generalversammlung.
Oberste Organe der Universität sind der Wissenschaftliche Beirat, das Rektorat, die Rektorin und der Senat. Die Universität ist in die vier Departments Biomedizinische Informatik und Mechatronik, Public Health und Health Technology Assessment , Pflegewissenschaft und Gerontologie sowie Medizinische Wissenschaften und Health Systems Management und in die eigenständigen Research Divisions für Krisen- und Katastrophenforschung und Mental Health untergliedert.
In seiner Arbeit wird die Geschäftsführung/das Rektorat durch die Stabstellen für Qualitätsentwicklung und Akkreditierungsangelegenheiten, juristische Beratung und Projektmanagement, Personalassistenz und Unternehmenskommunikation und durch die Abteilungen Studienmanagement, Marketing und Kommunikation und Finanzwesen unterstützt.