Biomedical Computer Science and Mechatronics

Institute of Electrical and Biomedical Engineering

Running theses

PhD (Dr.techn.)

  • R. Kienast."Untersuchung und Simulation der elektrophysiologischen Veränderungen beim Zelltod" (Baumgarten/Baumgartner)
  • P. Schier. "Compressed Sensing in Magnetorelaxometry Imaging" (Baumgarten)
  • A. Jaufenthaler. "Quantitative medizinische Bildgebung magnetischer
    Nanopartikel mittels Magnetorelaxometrie unter der
    Verwendung optisch gepumpter Magnetometer" (Baumgarten)
  • V. C. Gonella. "Computational models to investigate magnetic nanoparticles behavior for nanomedicine applications" (Baumgarten)

Completed theses

Habilitation

  • C. Baumgartner. "Knowledge discovery and data mining in biomedicine" (11/2005, 10/2006) 

PhD (Dr.techn.)

  • M. Handler. "Simulation and evaluation of the cryoablation procedure for treatment optimization of cardiac arrhythmias" (03/2018, Baumgarten/Baumgartner/Fischer)
  • M. Breit. "Bioinformatics methods for biomarker discovery in clinical methabolomics" (Baumgartner)
  • M. Wurz. "Infectious Disease Spread Simulation Utilizing Dynamic Parallelization of Grid-Enabled Web Services" (11/2010, Pfeifer)
  • M. Netzer. "Computational methods and strategies for searching biomarkers in complex biological mixtures" (09/2010, Baumgartner)
  • F. Cerqueira. "New computational strategies for tandem mass spectrometry data analysis in phosphoproteomics" (09/2010, Baumgartner)

MSc (Dipl.-Ing.)

  • J. Ellwanger. "Simulationsbasierte Evaluation der optimalen Elektrodenposition bei einem Vestibularimplantatmittels Partikel Schwarm Optimierung" (02/2018 Baumgarten, Handler, Schier)
  • L. Martin. "Ankle Dorsiflexion Dynamics: Development of a Neuromusculoskeletal Model" (11/2017 Baumgarten, Hanser)
  • P. Schier. "Computation and Evaluation of Targeted Vestibular Nerve Excitation based on Potential Distributions of Simulated Stimulation Scenarios" (10/2015 Baumgartner, Handler)
  • M. Toifl. "Quantitative Measurement of Left Ventricular Myocardial Perfusion using Contrast Agent Computed Tomography" (03/2012 Baumgartner, Rienmüller)
  • M. Schinner. "Patientenindividuelle Parametrierung von kardialen ventrikulären Tachykardieterminierungsalgorithmen" (12/2012 Hanser/Pfeifer)
  • O. Wrulich. "A simple Parallel Framework for Systems Biological Simulations using Probabilistic Multispecies Cellular Automata" (01/2012, Pfeifer)
  • C. Kutmon. "Computational methods for the search and biological interpretation of biomarkers in prostate cancer " (09/2011, Baumgartner)
  • C Hechenberger. "Simulation of Ventricular Tachycardias and Comparison of the Termination means of Different Types of Antitachycardia Pacing using Hybrid Automata" (09/2011, Pfeifer)
  • M. Baumann. "CAST - A Multithreaded Model-based Cellular Automaton Segmentation Approach" (07/2011, Pfeifer)
  • A. Pirker. "Erkennung von Kniegelenksbelastungen mittels einfacher Sensoren " (07/2011, Hanser/Baumgartner)
  • R. Kienast. "Application of semantic web technologies on biomedical data and their advantages concerning data integration" (09/2010, Baumgartner)

BSc

  • P. Schönegger. "Defibrillationselektroden - Messsystem" (04/2013 Baumgartner)
  • B. Renner. "Entwicklung eines Herz-Kreislauf-Simulator zu Demonstrationszwecken" (04/2013 Kienast/Baumgartner)
  • P. Schaffenrath. "Entwicklung eine Prototypen zur Bestimmung der Temperatur-Widerstandskennlinie eines Heizleiters zur Kalibrierung eines Impulsscheißgerätes" (04/2013 Kienast/Baumgartner)
  • G. Linder. "Implementierung einer webbasierten Fernwartung zur Steuerung eines Pelletsheizungsystems und Optimierung der zugehörigen Abgasgebläseregelung" (04/2013 Handler/Rienmüller/Baumgartner)
  • M. Gliber. "Lärmtechnische Beurteilung von Betriebsanlagen nach EN Normen – Praxisbeispiel Holzbearbeitungswerkstätte" (05/2012 Rienmüller/Baumgartner)
  • N. Huber. "Segmentierung von CT Datensätzen zur quantiativen Bestimmung der myokardialen Perfusion" (12/2012 Handler/Baumgartner).
  • C. Plattner. "Evaluierung von zeitlichen Unterschieden der ventrikulären Depolarisation innerhalb in-vivo und in-vitro registrierten Elektrokardiogrammen hochauflösender Multielektrodenarrays" (11/2012 Kienast/Baumgartner)
  • B. Weber. "T-Wellen Detektion innerhalb in-vivo und in-vitro registrierten Elektrokardiogrammen hochauflösender Multielektrodenarrays zur Evaluierung zeitlicher Unterschiede in der ventrikulären Repolarisationszeit" (11/2012 Kienast/Baumgartner)
  • M. Hofstetter. "Entwicklung eines sensorbasierten Wecksystems mit Schlafphasenüberwachung" (10/2012 Kienast/Baumgartner)
  • M. Hechenblaickner "Strahlendosisuntersuchungen und Interpretation nach EN Normen im Grossraum Hall" (10/2012 Hanser)
  • M. Seeber. "EMVU Belastungsuntersuchungen im HF-Bereich auf Basis aktuell gültiger EN-Normen und Richtlinien" (10/2012 Hanser/Baumgartner/Kienast)
  • M. Toifl. "A Pacemaker Simulation Framework" (03/2012, Pfeifer)
  • J. Eckhart. "Implementierung von Visualisierungsmethoden für Proteomische Daten im Knowledge Discovery in Databases Design Tool (KD3)" (09/2010, Baumgartner)
  • T. Schwarzbauer. "A Parametrizable Workfow for Proteomic Biomarker Identification using Mass-Spectrometry Data" (09/2010, Baumgartner)