Biomedical Computer Science and Mechatronics

Institute of Electrical and Biomedical Engineering

Overview of our Research Topics and Activities

Open topics: Bachelor of Science

Title Contact
Real-Time Processing of SEP-Measurements using g.USBamp Biopotential Amplifier gerald.fischer@umit-tirol.at
Modelling the Temperature Evolution during Magnetic Hyperthermia daniel.baumgarten@umit-tirol.at
Development of a simulation model for magnetic nanoparticles manuel.wolfschwenger@umit-tirol.at
Development of a Physiology based Pharmacokinetic Model for Magnetic Nanomaterials daniel.baumgarten@umit-tirol.at
Realtime frequency alalysis with FPGA aaron.jaufenthaler@umit-tirol.at
Experimental investigation of the temperature dependent behavior of magnetic nanoparticles aaron.jaufenthaler@umit-tirol.at
Evaluation of generalized Polynomial Chaos (gPC) strategies for EEG source reconstruction johannes.vorwerk@umit-tirol.at
Computersimulation von Wärmeverteilung therapeutischer Wärmesleeves daniel.baumgarten@umit-tirol.at

Open topics: Master of Science

Title Contact
Real time frequency analysis with FPGA aaron.jaufenthaler@umit-tirol.at
Development of a Software for Realtime Magnetorelaxometry Imaging aaron.jaufenthaler@umit-tirol.at
Experimental Setup to Determine the Signal Quality of an Amplifier System for Measuring Somatosensory Evoked Potentials (SEP) gerald.fischer@umit-tirol.at
michael.handler@umit-tirol.at
Simulation of Deep Brain Stimulation (DBS) with Mixed-FEM johannes.vorwerk@umit-tirol.at
EEG lead field interpolation in a realistic head model johannes.vorwerk@umit-tirol.at

Investigation of the influence of skull sutures on EEG source reconstruction

johannes.vorwerk@umit-tirol.at
External Master Thesis in Cooperation with iSYS - Interventional Systems (Wattens) daniel.baumgarten@umit-tirol.at
Analysis of the ocular surface vascular system based on external eye color photography daniel.baumgarten@umit-tirol.at
Semantic segmentation of external eye photography images daniel.baumgarten@umit-tirol.at
Development of a simulation model for magnetic nanoparticles manuel.wolfschwenger@umit-tirol.at

Your own ideas for Bachelor and Master thesis topics are welcome as well!

 

Running theses

PhD (Dr.techn.)

  • S. D'Alessandro
  • V. C. Gonella. "Computational models to investigate magnetic nanoparticles behavior for nanomedicine applications" (Baumgarten)

Completed theses

Habilitation

  • C. Baumgartner. "Knowledge discovery and data mining in biomedicine" (11/2005, 10/2006) 

PhD (Dr.techn.)

  • A. Jaufenthaler. "Quantitative biomedical imaging of magnetic nanoparticles by magnetorelaxometry with optically pumped magnetometers" (2022, Baumgarten)
  • P. Schier. "Determination and Validation of Effective Optimization Approaches for Improved Magnetorelaxometry Imaging Accuracy" (2022, Baumgarten)
  • R. Kienast."Untersuchung und Simulation der elektrophysiologischen Veränderungen beim Zelltod" (10/2018, Baumgarten/Baumgartner)
  • M. Handler. "Simulation and evaluation of the cryoablation procedure for treatment optimization of cardiac arrhythmias" (03/2018, Baumgarten/Baumgartner/Fischer)
  • M. Breit. "Bioinformatics methods for biomarker discovery in clinical methabolomics" (Baumgartner)
  • M. Wurz. "Infectious Disease Spread Simulation Utilizing Dynamic Parallelization of Grid-Enabled Web Services" (11/2010, Pfeifer)
  • M. Netzer. "Computational methods and strategies for searching biomarkers in complex biological mixtures" (09/2010, Baumgartner)
  • F. Cerqueira. "New computational strategies for tandem mass spectrometry data analysis in phosphoproteomics" (09/2010, Baumgartner)

MSc (Dipl.-Ing.)

  • P. Thaler. "Entwicklung eines Magnet-Partikel-Spektrometers (MPS) zur Quantifizierung von magnetischen Nanopartikeln (MNP) im Fluss" (2022, Baumgarten, Jaufenthaler)
  • P. Ostheimer. "Untersuchung der Lokalisationsgenauigkeit eines SQUID-Systems für die MRX-Bildgebung" (08/2020, Baumgarten, Schier)
  • J. Ellwanger. "Simulationsbasierte Evaluation der optimalen Elektrodenposition bei einem Vestibularimplantatmittels Partikel Schwarm Optimierung" (02/2018, Baumgarten, Handler, Schier)
  • L. Martin. "Ankle Dorsiflexion Dynamics: Development of a Neuromusculoskeletal Model" (11/2017, Baumgarten, Hanser)
  • P. Schier. "Computation and Evaluation of Targeted Vestibular Nerve Excitation based on Potential Distributions of Simulated Stimulation Scenarios" (10/2015, Baumgartner, Handler)
  • M. Toifl. "Quantitative Measurement of Left Ventricular Myocardial Perfusion using Contrast Agent Computed Tomography" (03/2012, Baumgartner, Rienmüller)
  • M. Schinner. "Patientenindividuelle Parametrierung von kardialen ventrikulären Tachykardieterminierungsalgorithmen" (12/2012, Hanser/Pfeifer)
  • O. Wrulich. "A simple Parallel Framework for Systems Biological Simulations using Probabilistic Multispecies Cellular Automata" (01/2012, Pfeifer)
  • C. Kutmon. "Computational methods for the search and biological interpretation of biomarkers in prostate cancer " (09/2011, Baumgartner)
  • C Hechenberger. "Simulation of Ventricular Tachycardias and Comparison of the Termination means of Different Types of Antitachycardia Pacing using Hybrid Automata" (09/2011, Pfeifer)
  • M. Baumann. "CAST - A Multithreaded Model-based Cellular Automaton Segmentation Approach" (07/2011, Pfeifer)
  • A. Pirker. "Erkennung von Kniegelenksbelastungen mittels einfacher Sensoren " (07/2011, Hanser/Baumgartner)
  • R. Kienast. "Application of semantic web technologies on biomedical data and their advantages concerning data integration" (09/2010, Baumgartner)

BSc

  • F. Schmid. "Konzeptionierung eines Fluss-Phantoms für die Untersuchung magnetischer Nanopartikel" (2022, Baumgarten, Jaufenthaler)
  • F. Koula. "Konzeptionierung und Bau eines Demonstrators zur Visualisierung der technischen Grundlage des Magnetic Drug Targeting" (11/2020, Schier)
  • M. Töchterler. "Experimentelle Ermittlung von magnetischen Suzeptibilitäten magnetischer Nanopartikel in Ferrofluiden mittels Software Defined Radio Lock-in-Verstärker" (2019, Jaufenthaler)
  • P. Schönegger. "Defibrillationselektroden - Messsystem" (04/2013, Baumgartner)
  • B. Renner. "Entwicklung eines Herz-Kreislauf-Simulator zu Demonstrationszwecken" (04/2013, Kienast/Baumgartner)
  • P. Schaffenrath. "Entwicklung eine Prototypen zur Bestimmung der Temperatur-Widerstandskennlinie eines Heizleiters zur Kalibrierung eines Impulsscheißgerätes" (04/2013, Kienast/Baumgartner)
  • G. Linder. "Implementierung einer webbasierten Fernwartung zur Steuerung eines Pelletsheizungsystems und Optimierung der zugehörigen Abgasgebläseregelung" (04/2013, Handler/Rienmüller/Baumgartner)
  • M. Gliber. "Lärmtechnische Beurteilung von Betriebsanlagen nach EN Normen – Praxisbeispiel Holzbearbeitungswerkstätte" (05/2012, Rienmüller/Baumgartner)
  • N. Huber. "Segmentierung von CT Datensätzen zur quantiativen Bestimmung der myokardialen Perfusion" (12/2012, Handler/Baumgartner).
  • C. Plattner. "Evaluierung von zeitlichen Unterschieden der ventrikulären Depolarisation innerhalb in-vivo und in-vitro registrierten Elektrokardiogrammen hochauflösender Multielektrodenarrays" (11/2012, Kienast/Baumgartner)
  • B. Weber. "T-Wellen Detektion innerhalb in-vivo und in-vitro registrierten Elektrokardiogrammen hochauflösender Multielektrodenarrays zur Evaluierung zeitlicher Unterschiede in der ventrikulären Repolarisationszeit" (11/2012, Kienast/Baumgartner)
  • M. Hofstetter. "Entwicklung eines sensorbasierten Wecksystems mit Schlafphasenüberwachung" (10/2012, Kienast/Baumgartner)
  • M. Hechenblaickner "Strahlendosisuntersuchungen und Interpretation nach EN Normen im Grossraum Hall" (10/2012, Hanser)
  • M. Seeber. "EMVU Belastungsuntersuchungen im HF-Bereich auf Basis aktuell gültiger EN-Normen und Richtlinien" (10/2012, Hanser/Baumgartner/Kienast)
  • M. Toifl. "A Pacemaker Simulation Framework" (03/2012, Pfeifer)
  • J. Eckhart. "Implementierung von Visualisierungsmethoden für Proteomische Daten im Knowledge Discovery in Databases Design Tool (KD3)" (09/2010, Baumgartner)
  • T. Schwarzbauer. "A Parametrizable Workfow for Proteomic Biomarker Identification using Mass-Spectrometry Data" (09/2010, Baumgartner)